肛肠科是国家中医药管理局“十二五”重点专科，市、省级重点建设专科。赣州市中医药学会肛肠专业委员会、赣州市肛肠病诊疗质量控制中心、赣州市肛肠病区域诊疗中心挂靠科室。医师团队有高级职称5人，中级职称1人，初级职称1人。护理团队有中级职称3人。承担完成了省、市级以上科研课题20余项，在国内医学刊物发表论文30余篇，拥有国家发明专利1项。 在高位复杂性肛瘘、便秘、直肠脱垂、肛门失禁等盆底疾病诊断及治疗上市内领先，省内知名。目前为市内唯一能开展结肠传输、排粪造影、盆底肌电评估、肛门测压、球囊逼出等便秘完整检查诊断的盆底治疗中心，也是率先开展使用肛门生物反馈结合中医药优势开展盆底疾病治疗的专科。